ความเสี่ยงต่อการเกิดปฏิกิริยาภูมิคุ้มกันในร่างกาย

การควบคุมปริมาณและเวลาของกิจกรรมอย่างแม่นยำเพื่อลดผลกระทบนอกเป้าหมาย การควบคุมกิจกรรม SpCas9 เหล่านี้ยังสามารถเป็นประโยชน์ต่อแอปพลิเคชั่นอื่น ๆ เช่นการแก้ไข DNA ของสิ่งมีชีวิตแบบจำลองให้เป็นแบบอย่างและศึกษาโรคอย่างมีประสิทธิภาพและการใช้ยีนไดรฟ์ในยุงวิศวกรรมพันธุวิศวกรรมยุงเพื่อควบคุมการแพร่กระจายของมาลาเรียและยุง

ความจำเป็นในการควบคุมขนาดและปริมาณของ SpCas9 ได้สร้างความต้องการโมเลกุลต่อต้าน CRISPR แม้ว่าโปรตีนต่อต้าน CRISPR ที่มีเป้าหมายเป็น SpCas9 นั้นมีขนาดใหญ่และไม่สามารถผ่านเข้าไปในเซลล์กลับไม่ได้ในทางปฏิบัติสามารถถูกเคี้ยวด้วยโปรตีเอสและอาจมีความเสี่ยงต่อการเกิดปฏิกิริยาภูมิคุ้มกันในร่างกาย ในทางตรงกันข้ามสารยับยั้งโมเลกุลขนาดเล็กนั้นมีความเสถียรโปรตีนย้อนกลับและโดยทั่วไปไม่มีภูมิคุ้มกันและสามารถส่งไปยังเซลล์ได้อย่างง่ายดายผ่านการแพร่กระจายแบบพาสซีฟ นอกจากนี้ยังสามารถสังเคราะห์ได้ในขนาดใหญ่ด้วยต้นทุนที่ต่ำพร้อมความแปรปรวนแบบชุดต่อชุดน้อย